Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NDST1P52848 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NDST1P52848 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NDST1P52848 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDST1P52848 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NDST1P52848 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NDST1P52848 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NDST1P52848 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NDST1P52848 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NDST1P52848 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDST1P52848 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NDST1P52848 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms