Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PGDP52209 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGDP52209 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGDP52209 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGDP52209 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PGDP52209 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGDP52209 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGDP52209 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGDP52209 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGDP52209 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PGDP52209 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms