Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
SMARCA4P51532 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
SMARCA4P51532 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SMARCA4P51532 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms