Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC40.38■■■■■ 4.06
SMARCA2P51531 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
SMARCA2P51531 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SMARCA2P51531 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
SMARCA2P51531 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.6 ms