Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCNN1BP51168 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCNN1BP51168 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms