Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBP50607 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBP50607 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBP50607 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBP50607 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBP50607 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBP50607 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBP50607 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBP50607 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBP50607 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBP50607 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBP50607 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBP50607 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBP50607 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBP50607 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBP50607 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBP50607 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBP50607 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBP50607 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBP50607 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBP50607 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBP50607 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms