Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX5P50542 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX5P50542 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX5P50542 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX5P50542 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PEX5P50542 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX5P50542 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX5P50542 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX5P50542 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PEX5P50542 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PEX5P50542 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PEX5P50542 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PEX5P50542 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms