Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN2P49810 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms