Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASP4P49662 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASP4P49662 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASP4P49662 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASP4P49662 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASP4P49662 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASP4P49662 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASP4P49662 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASP4P49662 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASP4P49662 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms