Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX1P48742 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX1P48742 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX1P48742 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LHX1P48742 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LHX1P48742 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LHX1P48742 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LHX1P48742 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX1P48742 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LHX1P48742 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LHX1P48742 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LHX1P48742 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LHX1P48742 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LHX1P48742 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX1P48742 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX1P48742 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX1P48742 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LHX1P48742 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LHX1P48742 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LHX1P48742 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LHX1P48742 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms