Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK1DP48730 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1DP48730 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms