Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLMP48507 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLMP48507 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLMP48507 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLMP48507 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLMP48507 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLMP48507 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLMP48507 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLMP48507 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLMP48507 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCLMP48507 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms