Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARCN1P48444 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARCN1P48444 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARCN1P48444 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms