Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GRIA4P48058 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRIA4P48058 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms