Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA2P48052 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA2P48052 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA2P48052 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA2P48052 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CPA2P48052 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CPA2P48052 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CPA2P48052 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CPA2P48052 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CPA2P48052 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CPA2P48052 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPA2P48052 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms