Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RECQLP46063 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RECQLP46063 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RECQLP46063 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RECQLP46063 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RECQLP46063 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RECQLP46063 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RECQLP46063 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RECQLP46063 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RECQLP46063 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RECQLP46063 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RECQLP46063 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RECQLP46063 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RECQLP46063 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms