Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYKP43405 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYKP43405 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYKP43405 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYKP43405 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SYKP43405 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYKP43405 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYKP43405 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYKP43405 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYKP43405 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYKP43405 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYKP43405 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYKP43405 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYKP43405 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYKP43405 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYKP43405 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYKP43405 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms