Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSR1P43307 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSR1P43307 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR1P43307 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR1P43307 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR1P43307 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR1P43307 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR1P43307 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSR1P43307 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSR1P43307 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSR1P43307 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSR1P43307 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSR1P43307 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SSR1P43307 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSR1P43307 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms