Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GDF5P43026 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GDF5P43026 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF5P43026 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF5P43026 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF5P43026 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GDF5P43026 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GDF5P43026 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GDF5P43026 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GDF5P43026 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF5P43026 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
GDF5P43026 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GDF5P43026 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GDF5P43026 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms