Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA1P42261 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIA1P42261 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms