Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL3P39023 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL3P39023 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL3P39023 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL3P39023 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL3P39023 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL3P39023 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL3P39023 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL3P39023 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL3P39023 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL3P39023 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL3P39023 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL3P39023 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL3P39023 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPL3P39023 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms