Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGHMBP2P38935 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGHMBP2P38935 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.8 ms