Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FDFT1P37268 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FDFT1P37268 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms