Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHI3L1P36222 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CHI3L1P36222 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms