Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CTNNB1P35222 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms