Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF2H1P32780 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF2H1P32780 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF2H1P32780 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms