Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3AP31941 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
APOBEC3AP31941 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC3AP31941 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC3AP31941 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms