Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC13P31276 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXC13P31276 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms