Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXA13P31271 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms