Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TSPOP30536 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TSPOP30536 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms