Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCKSP29966 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCKSP29966 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MARCKSP29966 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms