Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD34P28906 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD34P28906 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD34P28906 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD34P28906 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD34P28906 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CD34P28906 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CD34P28906 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CD34P28906 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CD34P28906 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CD34P28906 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CD34P28906 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CD34P28906 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CD34P28906 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms