Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DUSP1P28562 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP1P28562 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms