Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HTR2AP28223 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HTR2AP28223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HTR2AP28223 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms