Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPA1P27694 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPA1P27694 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPA1P27694 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPA1P27694 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA1P27694 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA1P27694 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA1P27694 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPA1P27694 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPA1P27694 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RPA1P27694 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA1P27694 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA1P27694 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPA1P27694 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPA1P27694 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPA1P27694 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPA1P27694 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPA1P27694 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPA1P27694 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA1P27694 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA1P27694 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPA1P27694 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPA1P27694 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms