Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HMGB2P26583 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGB2P26583 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms