Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCSHP23434 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCSHP23434 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCSHP23434 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms