Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FGFR3P22607 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FGFR3P22607 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms