Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FGFR4P22455 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGFR4P22455 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGFR4P22455 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms