Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK11BP21127 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms