Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NR1D1P20393 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms