Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRM3P20309 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRM3P20309 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRM3P20309 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms