Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC9A1P19634 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC9A1P19634 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC9A1P19634 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms