Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELK1P19419 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ELK1P19419 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ELK1P19419 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ELK1P19419 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ELK1P19419 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELK1P19419 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELK1P19419 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELK1P19419 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ELK1P19419 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ELK1P19419 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ELK1P19419 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ELK1P19419 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ELK1P19419 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms