Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNNI1P19237 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNNI1P19237 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI1P19237 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 421.5 ms