Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATF3P18847 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ATF3P18847 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ATF3P18847 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATF3P18847 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATF3P18847 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATF3P18847 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATF3P18847 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
ATF3P18847 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ATF3P18847 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ATF3P18847 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
ATF3P18847 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATF3P18847 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATF3P18847 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATF3P18847 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATF3P18847 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATF3P18847 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATF3P18847 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATF3P18847 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATF3P18847 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATF3P18847 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATF3P18847 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATF3P18847 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATF3P18847 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATF3P18847 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATF3P18847 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATF3P18847 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATF3P18847 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATF3P18847 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATF3P18847 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms