Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCLP18206 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCLP18206 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCLP18206 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VCLP18206 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VCLP18206 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VCLP18206 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VCLP18206 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VCLP18206 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VCLP18206 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCLP18206 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VCLP18206 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VCLP18206 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VCLP18206 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCLP18206 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCLP18206 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCLP18206 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCLP18206 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCLP18206 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VCLP18206 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VCLP18206 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms