Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPI1P17947 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPI1P17947 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SPI1P17947 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SPI1P17947 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SPI1P17947 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SPI1P17947 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms