Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GM2AP17900 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GM2AP17900 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GM2AP17900 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GM2AP17900 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GM2AP17900 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GM2AP17900 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GM2AP17900 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GM2AP17900 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GM2AP17900 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GM2AP17900 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GM2AP17900 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GM2AP17900 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GM2AP17900 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GM2AP17900 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GM2AP17900 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GM2AP17900 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GM2AP17900 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GM2AP17900 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GM2AP17900 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GM2AP17900 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms