Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKLP17858 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKLP17858 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKLP17858 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKLP17858 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKLP17858 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKLP17858 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKLP17858 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKLP17858 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKLP17858 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKLP17858 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKLP17858 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKLP17858 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKLP17858 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKLP17858 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKLP17858 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKLP17858 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms